Djelatnici Instituta za arheologiju sudjeluju u nastavi na preddiplomskoj, diplomskoj i doktorskoj razini studija arheologije na Sveučilištima u Hrvatskoj kao izvoditelji ili nositelji nastave. No osim sudjelovanja u nastavi znanstvenici s Instituta sudjeluju i kao gostujući i pozvani predavači na različitim Fakultetima. Specijalizacije djelatnika Instituta vezane su najčešće uz pojedina razdoblja ljudske prošlosti, a kroz poslijediplomsku naobrazbu i radom na znanstvenim projektima profilirani su stručnjaci za određene teme (pogrebni običaji, arhitektura, mozaici, obrambeni sustavi, gradišta, burgovi, radionička središta, sveta mjesta, analitička obrada nalaza). Specifična znanja kojima djelatnici Instituta raspolažu razlog su čestih mentorstava u diplomskom i doktorskom studiju, te članstva u komisijama za obranu tema i doktorskih radova.
| Razina studija | Sveučilište | Fakultet | Odjel/Odsjek | Akademska godina |
| Preddiplomski studij | Zagreb | Filozofski fakultet | Odsjek za arheologiju | od 2004. |
| Pula | Filozofski fakultet | Odsjek za arheologiju | od 2018. | |
| Zagreb | Fakultet hrvatskih studija | Kroatologija | 2013. – 2017. | |
| Diplomski studij | Zagreb | Filozofski fakultet | Odsjek za arheologiju | od 2009. |
| Poslijediplomski doktorski studij | Zagreb | Filozofski fakultet | Odsjek za arheologiju | od 2008. |